Je n'ai pas trouvé le POURQUOI, mais je suis arrivé tout de même à un COMMENT satisfaisant. (ouverture du fichier dans Ai,nettoyage (il y avait bcp de tracés inutiles à supprimer) et retouche approfondie du logo (utilisation de la transparence « obscurcir » car la « produit » donnait un résultat inapproprié), re-export en PDF selon les mêmes réglages qu'habituellement et là ça passe).
Si nécessaire, je peux partager les PDF en ligne, si un crack d'acrobat est capable de trouver où était la faille.