Je ne connais pas assez quicktime X pour te répondre, mais dans quicktime 7, c'est assez simple :
Tu poses un point d'entrée (raccourci "i") et un point de sortie ("o") aux marges de la portion que tu veux garder.
Edition->ne conserver que la selection.
A ce moment tu te retrouves avec uniquement la vidéo à conserver. Tu n'as plus qu'a faire "enregistrer sous", et c'est bon. Quicktime te crée un nouveau fichier, sans réencodage.