Je vois que tu as un Fusion Style apfs : 2 magasins de stockage Physical Stores dans les partitions disk0s2 (SSD) & disk1s2 (HDD) => qui exportent un Conteneur unique > avec ses 4 volumes réglementaires. Pas d'anomalie formelle. RAS. Mojave a bien effectué la conversion.
Tu as 972 Go de données dans le volume de démarrage Macintosh HD - ce qui est substantiel. Tu peux utiliser le logiciel GrandPerspective effectivement pour voir s'il y a des anomalies de distribution des données. Sinon > ça peut se faire à coups de commande du Terminal.
La question est : possèdes-tu une sauvegarde intégrale de Macintosh HD (genre : clone ou TM dans le volume d'un DDE) ? - si c'était le cas > une possibilité serait de démarrer sur le clone ou l'OS de secours de la TM > effacer le contenu du volume Macintosh HD > réinstaller Mojave en mode propre > puis utiliser au final l'Assistant de migration pour récupérer les données de la sauvegarde. L'intérêt de cette manœuvre est que le Système serait contenu exclusivement dans le Physical Store du SSD. Il serait possible alors de vérifier si tu aurais récupéré une vitesse normale.