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inputenc indiqueau moteur latex l'encodage d'entrée du fichier, pour qu'il puisse le convertir correctement vers l'encodage de sortie fontenc. Si votre éditeur est réglé sur Latin-1 ou UTF-8 et qu'inputenc est sur applemac (correspondant à Mac Roman, il y a une incohérence.
Pour avoir applemac, mettez votre éditeur (vim, emacs, TeXShop, iTeXMac ou autre ) en macroman. Ceci étant dit, cet encodage étant peu portable, mieux vaut utiliser Latin1, Latin9 ou UTF-8.