AptBackup pourrait te satisfaire .... Il créé une sauvegarde qui va se lier dans ta sauvegarde que fait iTunes.
En clair tu lance une sauvegarde de tes sources avec AptBackup, tu fais une sauvegarde de ton iPhone avec iTunes puis si tu restaures en remettant ta sauvegarde, t'as juste a réinstaller AptBackup et il te remettra toutes tes sources.
Sinon elles se trouvent la : /etc/apt/sources.list.d