Je ne comprends pas bien le sens de ta question.
En gros, iTunes et l'iPod organisent tes fichiers musique de la manière suivante.
Tous les fichiers sont présents dans la bibliothèque générale.
Tu crées des dossiers de compilation musicale et tu glisses dedans tes morceaux à partir d'itunes. Là, le morceau n'est pas dupliqué, mais un alias pointant vers le fichier d'origine est créé. Du coup, tu peux mettre les morceaux de ton choix dans les dossiers de ton choix sans alourdir ta bibliothèque principale.
Cela se passe de la même manière dans l'iPod.