Bonsoir,
J'ai eu la même expérience que toi,
et je m'en suis pas inquiété : j'ai vu ces derniers temps Apple pondre deux mises à jour successives portant le même numéro mais (légèrement) différentes (la seconde peaufinant la première sans que ça se voie trop…).
Ce soir, j'ai inspecté les receipts (merci à Time Machine),
et effectivement les deux versions sont légèrement différentes : 3.9.0.0.1 et 3.9.2.0.1.
La seconde a donc bien dû corriger un peu la première, mais pas assez pour qu'Apple accepte qu'on le voie (ou, tout au moins, si on veut éviter d'être mauvaise langue, pour qu'Apple décide de garder à disposition les deux versions sur son site Downloads).