Ce que j'ai suggéré, Remy, c'était pour tester : si l'installation de Sierra se passe bien sur le disque externe et que le démarrage sur ce dernier est OK, alors loubloum peut tranquillement installer Sierra sur son disque interne.Non ne fais pas ça... garde ton clone avec ElCapitan (bien à l'abri pour pouvoir revenir à ElCapitan si Sierra ne te convient pas) et installe Sierra sur le disque interne.
Installer Sierra sur le disque externe te donnera une idée fausse du fonctionnement de Sierra sur ton Mac car tu seras limité par le débit du port usb sur lequel le disque externe est branché.
Du coup, les précautions habituelles sont à respecter : clone du disque interne (sous El C) sur le disque externe. Puis installation de Sierra sur le disque interne.
Ca peut paraitre long, mais comme ça loubloum peut s'assurer a priori que Sierra tourne bien sur sa machine et avec ses applications (à l'exception de la vitesse qui évidemment ne sera pas terrible sur un dd externe).
Maintenant loubloum peut comme tu le suggères faire plus simple : clone sur le disque externe et installation directe de Sierra sur le disque interne.