Bon je viens de faire le teste de FireFox vers Safari et il m'a tout bien ranger, et je suis parti des réglages par défaut.
EDIT : J'ai viré tous mes bookmarks de Safari et refais l'export de FireFox à Safari et tout est nickel, exactement comme sur FireFox.
Soit 826 liens répartis dans 21 dossiers qui se retrouvent tous bien rangés dans ma barre de favori de Safari.
EDIT2 :
J'ai ouvert BookMacster, puis:
File > New Collection (enregistrer la liste à l'emplacement par défaut : home/bilbiothèque/Application Support/BookMacster/Collections) > Là, je place Firefox en tête de liste puis Safari en dessous, je coche "import" pour Firefox (import dans liste.bmco) et coche "Export" pour Safari (Export depuis la liste.bmco vers Safari) > Onglet Agents, je clique sur le bouton "No Syncing/Full Syncing" et le voyant de Syncing se met au jaune et s'éteint une fois le travail fini.
Je ne touche à rien d'autre.
Après tu peux synchroniser dans les deux sens si tu veux à toi de voir suivant tes usages. Et remettre iCloud pour les idevices.