Si on excepte le cas de figure ou tu embarques aussi un système sur ton disque externe, et que tu démarres sur ce système pour te servir de ta compta, la démarche parait hasardeuse, mais à mon avis, c'est à leur support technique qu'il faut poser la question si tu souhaite une réponse fiable.
Il faut savoir aussi que quelle que soit la configuration, les "données comptables" ne seront pas installées dans le dossier de l'application si le logiciel est programmé dans les règles !