Normalement ça va.
Le plus gros problème, ce sont les vers/virus qui se font passer pour le plug-in flash ou java...
C'est là que réside la plupart du temps le problème. D'où le fait qu'on préconise de les télécharger uniquement sur le site officiel des développeurs (adobe.com etc.).
Maintenant, tu peux utiliser un plug-in ClickToFlash pour pouvoir tout de même voire certains contenus à la volée...