Parceque Applications (dans un Users) et Bibliothèque ne vont pas forcément correspondre au système réinstallé. Outre la place que cela prendra pour rien, ça peut poser des problèmes.
Pour tes logiciels (Parallels, Adium), il faudra les réinstaller depuis leur support d'installation.
Si tu veux récupérer ta machine virtuelle Parallels, tu pourras, après réinstallation de Parallels, copier ta machine virtuelle (fichiers). N'utilisant pas Parallels (mais Fusion), il faudra que tu vois dans la section "Windows sur Mac" pour que quelqu'un t'indique où sont les fichiers de ta machine virtuelle.
De toute façon, une fois que tu as ta sauvegarde, tu la gardes au chaud, et tu pourras taper dedans pour remettre des trucs au fur et à mesure (si tu en as oublié). Mais sur un système propre, commence par ne remettre que tes documents.
(évidemment, si tu avais eu une sauvegarde Time Machine à jour et une clé USB/DVD d'installation de Lion par avance, ça aussi été beaucoup plus simple et rapide

) D'ailleurs, dés à présent, depuis ton iMac, tu peux faire un DVD/clé USB d'install de Lion en le re-téléchargeant depuis le MAS avec ton compte qui l'a acheté (
http://forums.macg.co/mac-os-x/impossible-de-retelecharger-lion-764352.html) et en utilisant Lion Disk Maker.