Si c'est intégré dans le chipset Intel de base, il parait logique que les ports USB soient compatible USB2 et USB3. Je vois pas pourquoi ils se feraient chier à faire une bidouille hardware pour supprimer la compatibilité USB3.
Ensuite, USB3 et Thunderbolt ce n'est pas la même chose, pas le même objectif et pas la même utilisation.
Autant brancher un disque dur externe en USB3 pour faire son timemachine quotidien est tout à fait logique, autant brancher une usine à gaz couteuse sur le thunderbolt pour le faire n'a pas dintérêt.
Concernant le stockage, thunderbolt à plutôt l'air étudié pour relier des NAS, du SAN ou des systèmes RAID à haute vitesse, mais brancher un simple disque dur qui de toute façon va saturer au 1/20ème du débit de thunderbolt, ça na pas de sens. Rien que le prix des connectiques thunderbolt plombe le prix d'un boitier externe de ce type.
Non, l'USB3, Apple à tout intéret à l'implémenter, et ça ne concurrence en rien thunderbolt qui est destiné à d'autres tâches. Mais pour le particulier, aller plus vite avec son timemachine ou ses accessoires USB, oui cela à de lintérêt.