Il ne faut pas confondre AppCleaner et Smart Delete AppCleaner. Le second est bien un agent qui tourne en tâche de fond.
AppCleaner est un bon logiciel, qui n'efface pas de fichiers système. Il est plébiscité, y compris sur ce forum, vous ne trouverez personne qui a altéré son OS avec AppCleaner. Ce n'est pas comme certains logiciels d'entretien qui sont mauvais, là aussi, bien connus sur ce forum.
Smart Delete est inutile et ne devrait pas être activé.
Dans tous les cas, comme le rappelle Sly, il faut prendre de bonnes habitudes : faire une sauvegarde du système (Timemachine ou autre) à intervalle régulier et s'y tenir.
Si augmenter la RAM reste une bonne idée, je persiste à penser que tu as trop de helpers et autres launch agents sur ta machine.